منطقه ویژه اقتصادی یزد در سال 1379 بر اساس تبصره 25 قانون برنامه دوم توسعه توسط "شورایعالی مناطق آزاد تجاری - صنعتی"، در زمینی به مساحت 570 هکتار و صرفاً به منظور فعالیت در حوزه نساجی مورد تصویب قرار گفته و "شرکت شهرکهای صنعتی استان یزد" به عنوان سازمان مسئول منطقه یاد شده تعیین گردیده است. با فراهم شدن امکانات سخت افزاری و نرم افزاری لازم، گمرک منطقه ویژه در سال 1385 رسماً عملیاتی و با اخذ مصوبه عام شدن حوزه فعالیتهای آن در دور اول سفر هیات محترم دولت به استان در فعالیتهای آن نقطه عطفی ایجاد و به دنبال آن در شهریور ماه 86 رسماً مورد بهرهبرداری قرار گرفت. از جمله اهداف خاص ایجاد منطقه ویژه اقتصادی یزد به موارد ذیل می‌توان اشاره داشت:
- توسعه صادرات و ورود به بازارهای رقابتی جهانی، از طریق کاهش هزینه‌های تولید
- بهره گیری از امکانات جهانی جهت رشد و تحرک اقتصاد ملی و منطقه ای
- ارایه تسهیلات قانونی جهت واردات و صادرات کالاهای تجاری و صنعتی
- گسترش صنعت ترانزیت، صادرات مجدد و انتقال کالا (ترانشیب)
- جلب و تشویق سرمایه گذاری داخلی و خارجی و ایجاد اشتغال مولد